MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 6784

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018630	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018630	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018630	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018630	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018630	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018630	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018630	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018630	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018630	T	6	6	1586	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018630	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018630	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018630	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018630	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018630	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018630	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018630	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018630	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018630	A	7	7	4341	4347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018630	TCT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018630	AAT	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018630	TAA	2	6	8511	8516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018630	GA	3	6	14333	14338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018630	CT	3	6	14348	14353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018630	T	6	6	14353	14358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018630	A	9	9	14940	14948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018630	A	7	7	14951	14957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018630	AGT	2	6	14966	14971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018630	AAC	2	6	15015	15020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018630	CGG	2	6	15061	15066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018630	TGA	2	6	15119	15124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018630	A	7	7	15124	15130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018630	A	6	6	15135	15140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018630	A	6	6	15155	15160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018630	GA	3	6	15209	15214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018630	ACA	2	6	15271	15276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018630	GTA	2	6	15283	15288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018630	A	7	7	15299	15305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018630	TGAG	2	8	15330	15337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018630	GGC	2	6	15385	15390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018630	AGG	2	6	15420	15425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018630	GCTT	2	8	15427	15434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018630	CCTG	2	8	15475	15482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018630	TGG	2	6	15604	15609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018630	CGA	2	6	15628	15633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018630	GCA	2	6	15702	15707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018630	CGC	2	6	15749	15754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018630	GTGA	2	8	15755	15762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018630	TGT	2	6	15788	15793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018630	AGA	2	6	15797	15802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018630	CAG	2	6	15871	15876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018630	AGCG	2	8	15926	15933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018630	TAG	2	6	15978	15983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018630	AT	3	6	16055	16060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018630	GGA	2	6	16061	16066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018630	CT	3	6	16086	16091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018630	GAA	2	6	16325	16330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018630	GAC	2	6	16356	16361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018630	GGT	2	6	16399	16404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018630	GTC	2	6	16413	16418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018630	TCGTG	2	10	16422	16431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018630	CAT	2	6	16481	16486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018630	TAA	2	6	16516	16521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018630	GGA	2	6	16525	16530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018630	ATC	2	6	16549	16554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018630	AC	3	6	16576	16581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018630	CGC	2	6	16715	16720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018630	AC	3	6	16745	16750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018630	CAC	2	6	16760	16765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018630	AGCC	2	8	16807	16814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018630	GAT	2	6	16830	16835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018630	CCT	2	6	16886	16891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_018630	TAAGGA	2	12	16895	16906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018630	AGG	2	6	16985	16990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018630	GA	3	6	17023	17028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018630	GTA	2	6	17100	17105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018630	TAA	2	6	17107	17112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018630	GTTAA	2	10	17143	17152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018630	CGA	2	6	17188	17193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018630	ACG	2	6	17206	17211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018630	GTAA	2	8	17229	17236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018630	GAT	2	6	17239	17244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018630	GAG	2	6	17309	17314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018630	TAG	2	6	17377	17382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018630	GCGA	2	8	17385	17392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018630	AGA	2	6	17464	17469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018630	AG	3	6	17492	17497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018630	CGG	2	6	17548	17553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018630	GGA	2	6	17580	17585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018630	GGGAG	2	10	17661	17670	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018630	ACA	2	6	17698	17703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018630	ATG	2	6	17765	17770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018630	GGA	2	6	17898	17903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018630	TC	3	6	17984	17989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018630	ACC	2	6	18164	18169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018630	AAT	2	6	18184	18189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018630	AGC	2	6	18244	18249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018630	ATTC	2	8	18251	18258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018630	TG	3	6	18373	18378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018630	GAG	2	6	18394	18399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018630	GA	3	6	18524	18529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018630	ACA	2	6	18550	18555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018630	CTAA	2	8	18605	18612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018630	GTCT	2	8	18630	18637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018630	TAG	2	6	18707	18712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018630	GA	3	6	18820	18825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018630	CT	3	6	18936	18941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018630	GAT	2	6	18954	18959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018630	CGG	2	6	19045	19050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018630	GA	3	6	19143	19148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018630	TAGG	2	8	19261	19268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018630	TAC	2	6	19315	19320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018630	CCT	2	6	19403	19408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018630	GGT	2	6	19539	19544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018630	TCG	2	6	19654	19659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018630	CGT	2	6	19734	19739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018630	AGGGA	2	10	19872	19881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018630	TA	3	6	19938	19943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018630	GA	3	6	19958	19963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018630	GAAGTG	2	12	19983	19994	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018630	ACTAAT	2	12	20013	20024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018630	TTGAA	2	10	20076	20085	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018630	AGT	2	6	20192	20197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018630	GTA	2	6	20259	20264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018630	ATG	2	6	20282	20287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018630	T	6	6	20341	20346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018630	TAA	3	9	20353	20361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018630	AAG	2	6	20887	20892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018630	GAA	2	6	20907	20912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018630	GAA	2	6	21319	21324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018630	CTTT	2	8	21355	21362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018630	T	6	6	21360	21365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018630	TGA	2	6	21413	21418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018630	ATT	2	6	21420	21425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018630	GTG	2	6	21554	21559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018630	TTA	2	6	21603	21608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018630	AAG	2	6	22086	22091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018630	ATA	2	6	22130	22135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018630	TA	3	6	22138	22143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018630	TTG	2	6	22266	22271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018630	T	6	6	22318	22323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018630	A	6	6	22340	22345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018630	ATA	2	6	22647	22652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018630	T	6	6	22681	22686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018630	TCT	2	6	22719	22724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018630	T	6	6	22739	22744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018630	TAA	2	6	22749	22754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_018630	T	6	6	24256	24261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018630	AAT	2	6	24296	24301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018630	T	6	6	25611	25616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018630	TA	3	6	26497	26502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_018630	CTAT	2	8	66920	66927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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435	NC_018630	CAG	2	6	117471	117476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_018630	ACA	2	6	117777	117782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_018630	A	6	6	117794	117799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_018630	CAG	2	6	117884	117889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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440	NC_018630	CAG	2	6	117926	117931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_018630	A	6	6	118249	118254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_018630	CAG	2	6	118382	118387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_018630	AAC	2	6	119104	119109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_018630	CAG	2	6	121023	121028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_018630	GCT	2	6	122148	122153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_018630	GTT	2	6	122192	122197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_018630	GTT	2	6	122860	122865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_018630	GTG	2	6	122945	122950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_018630	T	7	7	126617	126623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_018630	ATAA	2	8	126753	126760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_018630	A	6	6	126759	126764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_018630	T	6	6	128796	128801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_018630	TA	4	8	131989	131996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_018630	A	6	6	131996	132001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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